新台币的前身为台币，又称为旧台币，在1945年5月22日开始发行。当初旧台币被定位为一种过渡时期的货币，日治政府的台币与国民政府的台币一比一兑换。由于当时中国大陆战后金融状况不稳定，因此台湾未使用当时通行于中国大陆的法币、金圆券，另外再发行台币。
关于发行新台币原因的官方说法，是由于1948年上海爆发金融危机，连带也使旧台币币值大幅贬值，造成台湾物价水准急剧上扬。
不过另一种关于发行新台币原因的版本，指出是因为所谓的台湾光复初期，国民党在台湾把一些民生物资，如糖、米之类的，都搜括到中国本土去进行所谓的剿共，造成台湾内部民生物资短缺，使得台湾的米价甚至比上海当地的米价还高，因此造成台湾通货膨胀，一日三市，币值急速贬值，就算有钱也可能买不到米。另根据《228研究增补报告》中央研究院院士黄彰健、研究员朱宏源及武之璋合著，是因为日本在将台湾移交给国民政府前故意取消粮食管制，又运来大批钞票让准备返国的官员搜购日用品，才导致接下来的粮食匱乏、物价高涨。
在1949年6月15日台湾省政府公布“台湾省币制改革方案”、“新台币发行办法”，正式发行新台币，明订40,000元旧台币兑换1元新台币。1950年6月21日行政院发布命令，中华民国国币单位保留银元本位，而记帐单位自1950年7月1日起改为新台币，银元与新台币以1949年12月29日最后牌告汇率固定为3：1。
1956年8月29日台湾司法院大法官释字第63号解释：《妨害国币惩治条例》第三条所称伪造变造之币券，是指国币币券而言。新台币为地方性之币券，如有伪造变造情事，应依刑法处断。
准国币时期
1961年7月1日台湾中央银行在台复业，依照“中央银行在台湾地区委托台湾银行发行新台币办法”，由中央银行委托台湾银行发行，纸币上印“台湾银行”字样，法定地位比照国币，成为今日中华民国的法定货币。自1970年12月21日开始，钞券上印“中华民国”字样，以昭公信。另外为因应金门、马祖、大陈岛等战地的特殊需要，也曾经发行限定流通这些地区的新台币金门、马祖、大陈流通券，目前则已经取消。
1962年12月19日中华民国司法院大法官释字第99号解释：台湾银行发行之新台币，自中央银行委托代理发行之日起，如有伪造变造等行为者，亦应依妨害国币惩治条例论科。
国币时期
1992年原“银元及银元兑换券发行办法”公告废止，作为国币之银元丧失发行法源。由于国币依中央银行法规定由中央银行发行，于是在2000年7月1日订颁“中央银行发行新台币办法”，停止委托台湾银行发行，将新台币正式订为国币。7月3日发行1000圆纸币，上印字样改为“中央银行”。
2002年6月30日废止“中央银行在台湾地区委托台湾银行发行新台币办法”，2003年6月30日原委托台湾银行发行之新台币停止流通。当时曾有人质疑此举是否为伸张“中华民国在台湾为主权独立国家”之主张，官方回应为：自1961年7月1日中央银行在台复业起，新台币发行单位法定即为中央银行，中央银行依据该行组织法规定，委托台湾银行发行，纸钞原印“台湾银行”仅代表实际发行单位。
目前流通之钞券与硬币
1000圆及500圆于2005年7月20日再度改版，增加原本只有2000圆才有的光影变化箔膜，安全线改为光影变化箔膜式安全线。500圆的刷色由变得更深，其余图样则未改变。
